Entre las obras compuestas y estrenadas por Borja Mariño se encuentran:
Sonata para violín y piano
Estrenada en el Teatro García Barbón de Vigo, el día 10 de junio de 1999, con Cibrán Sierra (violín).
Cuatro canciones antiguas sobre textos sefardíes:
1. Demudada de mi amado
2. Altas voces doloridas
3. La cabecita a la luna
4. Jeux d’enfants
Estrenadas en la Sociedad Filarmónica de Monforte, el 8 de febrero de 2002, con Patricia Blanco (soprano).
Las Cuatro canciones antiguas se ofrecieron en versión orquestal en el Auditorio Nacional de Música de Madrid el 25 de febrero de 2011 con la soprano Saioa Hernández y el director Alejandro Jassán.
Actualmente prepara la grabación en cd de algunas de sus canciones, incluyendo el estreno del ciclo:
Tres canciones sobre textos gallegos:
1. Lua de vrau
2. Saudade
3. Cantiga de amigo
El 25 de febrero de 2012 se podrán escuchar las Cuatro canciones antiguas sobre textos sefardíes en una nueva orquestación de Alejandro Jassán en el Auditorio Nacional de Madrid.
